طراحی و بهینه سازی تست pcr برای تشخیص سریع پاتوتایپ های انترواگریگیتیو و انتروتوکسی ژنیک اشرشیاکلی

Authors

محمد سلیمانی

mohammad soleimani qom branch, islamic azad universityدانشگاه آزاد اسلامی، قم عباس مروتی

abbas morovvati qom branch, islamic azad universityدانشگاه آزاد اسلامی، قم علی جوادی

ali javadi tehran university of medical sciencesدانشگاه علوم پزشکی تهران

abstract

زمینه و هدف: اشرشیاکلی به عنوان یکی از مهم ترین عوامل ایجادکننده بیماری اسهالی حاد در دنیا مطرح است. بیماری های اسهالی یکی از علل اصلی مرگ و میر در میان کودکان کشورهای درحال توسعه می باشند. این مطالعه با هدف توسعه تکنیک pcr برای تشخیص اختصاصی ژن های ویرولانس پاتوتایپ های انترتوکسی ژنیک اشرشیاکلی (etec) و انترواگریگیتیو و اشرشیاکلی (eaec) انجام شد. روش بررسی: در این مطالعه برای تشخیص پاتوتایپ ها etec-eaec، از ژن های اختصاصی st و lt (برای تشخیص پاتوتایپ etec) و از ژن اختصاصی aafii (برای شناسایی پاتوتایپ eaec) استفاده شد. این تکنیک pcr برای این سه ژن طراحی و بهینه گردید. محصولات واکنش برای هریک از این ژن ها، در وکتور ptz57r/t به عنوان کنترل مثبت، کلون و مورد استفاده قرار گرفت. میزان حساسیت پرایمر ها با محاسبه کمترین میزان تشخیص (limit of detection) و استفاده از ژنوم سایر باکتری ها به عنوان بررسی اختصاصیت پرایمر ها ارزیابی شد. یافته ها: با توجه به نتایج آنالیز محصولات pcr بر روی ژل الکتروفورز باند های مورد نظر برای ژن aafii، lt و st به ترتیب 384 ، 459 و 150 جفت باز به دست آمد. همچنین واکنش ژنوم باکتری های کنترل با پرایمر های طراحی شده، منفی بود. حد تشخیص براساس تعداد کپی برای ژن های st، lt و aafii به ترتیب برابر 390 ، 1500 و 2500 کپی به دست آمد. نتیجه گیری: با توجه به نتایج این مطالعه، طراحی این گونه تست ها در ایران به عنوان یک پیشرفت در زمینه بهبود تشخیص سریع و دقیق پاتوژن ها و تفکیک در نوع پاتوتایپ های اشرشیاکلی می باشد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

طراحی و بهینه‌سازی تست PCR برای تشخیص سریع پاتوتایپ‌های انترواگریگیتیو و انتروتوکسی‌ژنیک اشرشیاکلی

زمینه و هدف: اشرشیاکلی به‌عنوان یکی از مهم‌ترین عوامل ایجادکننده بیماری اسهالی حاد در دنیا مطرح است. بیماری‌های اسهالی یکی از علل اصلی مرگ و میر در میان کودکان کشورهای درحال توسعه می‌باشند. این مطالعه با هدف توسعه تکنیک PCR برای تشخیص اختصاصی ژن‌های ویرولانس پاتوتایپ‌های انترتوکسی‌ژنیک اشرشیاکلی (ETEC) و انترواگریگیتیو و اشرشیاکلی (EAEC) انجام شد. روش بررسی: در این مطالعه برای تشخیص پاتوتایپ‌ها...

full text

بهینه سازی روش HRM-Real Time PCR برای تشخیص کرم قلب

مطالعه اکولوژی انگلهای سگ های ولگرد از اهمیت زیادی برخورداراست. باتوجه به  امکان انتقال انگل های مشترک از سگ های ولگرد به انسان، این انگل ها از جمله خطرات بالقوه جوامع انسانی امروز محسوب می شود که نیاز به مطالعات جامع دارد. دیروفیلاریا ایمیتیس انتشار جهانی دارد و ایران یکی از مناطق اندمیک برای این آلودگی است.ازاین رو، تحقیق حاضر با هدف بررسی آلودگی به دیروفیلاریا ایمیتیس در سگ ها ی ولگرد استان ...

full text

طراحی یک روش سریع برای تشخیص کیست هیداتیک در گوسفند

زمینه مطالعه: استفاده از یک آزمون سریع و مقرون بصرفه برای تشخیص هیداتیدوز بعنوان بیماری مشترک بین انسان و حیوان می‌تواند بسیار مفید باشد. هدف: هدف از بررسی حاضر طراحی و بکارگیری نوعی روش سریع در تشخیص هداتیدوز بوده است. روش کار: ‌دو نوع آنتی‌ژن مایع خام و آنتـی‌ژن همـوژنیـزه پـروتـواسکـولکس تهیه و الگوی الکتروفورتیک آنها توسط الکتروفورز با سدیم دودسیل سولفات تعیین شد. برای تهیه سرم هیپرایمیون ا...

full text

طراحی و سنتز حس‌گر رنگ‌سنجی جدید برپایه کینازولینون برای تشخیص سریع و انتخابی یون مس (II)

در این مطالعه، یک حس‌گر شیمیایی رنگ‌سنجی جدید برپایه کینازولینون برای تشخیص یون‌های مس (II) طراحی و سنتز شد. ساختار حس‌گر سنتز شده (C) بوسیله روش‌های طیف‌سنجی زیرقرمز تبدیل فوریه (FT-IR)، رزونانس مغناطیسی هسته هیدروژن ( 1H NMR) و رزونانس مغناطیسی هسته کربن (13C NMR) بررسی و تایید شد. حس‌گر شیمیایی C حساسیت و گزینش‌پذیری عالی برای تشخیص یون مس (II) در میان تمام کاتیون‌ها و آنیون‌های بررسی شده در...

full text

شناسایی سریع هلیکوباکترپیلوری توسط روش ملکولی PCR در مقایسه با تست اوره آز سریع (RUT)

سابقه و هدف: هلیکوباکترپیلـوری (H.pylori) به عنوان یک عامل عمده خطـر زخم‌های معده و دوازدهه و سرطان معده شناخته شده است . روش های مختلفی برای تشخیص این میکروارگانیسم شناخته شده که متداول ترین آن ها به خصوص در بیمارانی که تحت آندوسکوپی قرار می گیرند، تست اوره آز سریع (RUT) می باشد ، اما این تست برای ایجاد نتایج مثبت و منفی کاذب بالقوه می باشد . لذا بکارگیری روشی سریع ، ساده و آسان اما با دقت ب...

full text

بکارگیری الگوریتم طراحی سریع در مبدل‌های قاب و صفحه‌ای و توسعه شاخصی برای انتخاب سطح بهینه

مبدل‌ها‌ی قاب و صفحه‌ای در اکثر صنایع به‌ویژه در صنایع غذائی و لبنی کاربرد گسترده‌ای یافته‌اند. با توجه به محدوده وسیع به‌کارگیری مبدل‌های حرارتی در افت فشارهای گوناگون و میزان انتقال حرارت‌های مختلف، دست‌یابی به شاخص‌های عملکردی در مبدل‌های قاب و صفحه‌‌ای امکان مقایسه ساده‌تر و عملی‌تری را برای مهندسین فراهم می‌آورد. اگر چه تاکنون شاخص‌های متعددی ارائه شده است ولی در این مقاله با در نظر گرفتن ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
مجله دانشگاه علوم پزشکی قم

جلد ۱۰، شماره ۱۰، صفحات ۲۵-۳۳

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023